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作者：Mike May/ 文 高大海 倪伟波/ 译 来源： 发布时间：2018-6-26 16:58:13
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一个被遗忘的第四类分子生物学可能是最贴近表型的。几十年来，人们一直专注于三个分子：DNA产生RNA，RNA产生蛋白质。现在，许多科学家都开始注意到了另一个组分：代谢产物，它们是由机体内的生化途径中的蛋白质所产生的。人们听到了太多关于基因和基因型的信息，但同样重要的是，人们想要探究基因与环境因子互作时发生了什么，同样也想找到区分健康与疾病的分子表型，这些正是代谢组学的用武之地。
毫无疑问，那些着眼于欧宝体育平台的相互元素的系统生物学家想要将代谢组学与基因组关联起来。“没有基因组序列，代谢组学不能真正发挥自身作用，”位于美国加州门洛帕克的专门从事基因组学分析的Pacific Biosciences公司首席科学官Jonas Korlach说 。“一旦你发现了代谢产物并想将它们作为新抗生素或新途径进行分析，就需要基因组信息来鉴定出相关的酶并克隆这些基因。”
西澳大利亚莫道克大学的分离科学和代谢组学实验室主任Robert Trengrove同意这种看法，尽管代谢组学对系统生物学的影响尚处于起步阶段，但他看到了积极的开始，而且关键在于团队合作。 “在 ‘组学’方面我们有很擅长做信息学的人，”Trengrove说，“但很少有人能跨多个‘组学’领域，包括脂类组学和表观遗传学。”
Trengrove的团队已经联合其他团队，通过从ICU采集血液样本构建患者的代谢谱。他说，“通过这种方式，我们能够开始评估各种化合物作为生物标记物和病人康复指示物的用途。”为了确切知道发生了什么，生物标记模块必须与蛋白质组学和基因组学相关联，但这项工作才刚刚展开。
尽管如此，系统生物学已经成为了生物学的核心。传统上，生物学已将机体或细胞分解为各个部分。现在，系统生物学似乎接受了亚里士多德的观点——“整体大于其组成部分的总和”，并借用包括代谢组学等多个领域的方法。用于处理来自这些领域统称为“大数据”的工具正在涌现。
关于数据的再思考
总体来说，代谢组学创造了一个数字挑战。“代谢组学目前的用处包括：在生物样品库中研究大规模基因组队列，将基因型和具有特定表型的基因组变异相关联，通过监测食品成分或内源性代谢物的营养研究，或为流行病学研究中的检� |
